El Observatorio pone a disposición un conjunto de bases de datos que constituyen un medio para dar a conocer al sector industrial los recursos disponibles en España para la realización de las investigaciones relacionadas con el sector de la acuicultura. Ofrecen la posibilidad de conocer aspectos tales como investigadores, áreas temáticas de trabajo, comunidades autónomas, grupos taxonómicos, especies, empresas, etc.).
Los datos se recopilan en las siguientes bases de datos: