AQUAGENOMICS

• PLANTEAMIENTO PROYECTO

Este proyecto se basa en el estudio y la optimización de diversos aspectos relevantes en el cultivo de tres especies claves en la acuicultura española: el rodaballo, la dorada y la lubina, desde una perspectiva genómica y biotecnológica. A pesar de que las herramientas y el conocimiento no pueden ser transferidos directamente de una especie a otra, los recursos genómicos existentes y el mapeo comparado serán de gran utilidad para avanzar de forma conjunta. Por otro lado, el "know-how" y la experiencia tecnológica que se obtengan en una especie pueden ser implementados en la investigación de aspectos similares en otra y por lo tanto los participantes del consorcio se beneficiarán mutuamente de este esfuerzo conjunto de investigación.


• OBJETIVOS

1.- Desarrollo de microarrays específicos que permitan estudiar perfiles de expresión génica característicos de determinados procesos críticos para el éxito del cultivo de las distintas especies objeto de la propuesta.
2- Aplicación de las herramientas genómicas y bioinformáticas para:
a) el estudio de la respuesta inmune de los peces frente a los patógenos de mayor interés en las especies seleccionadas desde una perspectiva de interacción "patógeno hospedador" con el fin de mejorar los procesos de vacunación e inmunoestimulación. Evaluar el potencial empleo de genes de patógenos relacionados con virulencia y patogenicidad para desarrollar nuevos métodos de prevención de las enfermedades.
b) la identificación de factores importantes para el crecimiento, el desarrollo y la nutrición en peces que puedan ser utilizados para potenciar el crecimiento y, por consiguiente, la producción de especies de interés en acuicultura.
c) la identificación de factores importantes para la determinación, diferenciación y maduración sexual que puedan ser usados para la selección de reproductores, en el establecimiento de poblaciones monosexo y en el control de la pubertad
3. Identificación de marcadores y genes candidatos a través de perfiles de expresión génica y de QTLs mediante la aplicación de mapas genéticos que permitan su aplicación en procesos de selección de reproductores. Avance en el desarrollo del mapa genético de rodaballo mediante el mapeo de ESTs sobre el mapa de microsatélites existente para fortalecer la estrategia de búsqueda de genes candidatos mediante los estudios de genómica comparada y la identificación de QTLs. Desarrollo de programas de selección asistida por marcadores en relación con empresas del sector.
4. Fomento de la transferencia de información entre grupos de investigación y la industria y la formación de personal altamente cualificado. Creación de un portal web para el acceso único y centralizado a las distintas partes del proyecto.
5. Formación de personal investigador altamente cualificado. Creación de programa internacional de doctorado de Biotecnología en Acuicultura. Establecer una plataforma de formación a nivel postdoctoral en Genómica y Bioinformática.

Destinatarios: 

Empresas productoras de Acuicultura, productores de piensos, empresas de biotecnología.

Actuaciones: 

Las tres especies de peces objeto de estudio en el presente proyecto, presentan aspectos que inciden en la rentabilidad de su cultivo de una forma común, como es el caso de las enfermedades infecciosas. Entre los patógenos que afectan al cultivo de rodaballo, el protozoo escuticociliátido Philasterides dicentrarchi, y los virus de la septicemia hemorrágica (VHS) causa también una disminución de la producción en esta especie. En la dorada, la pasteurelosis (Photobacterium damsela subsp. piscicida) es una de las enfermedades más comunes y que puede producir importantes pérdidas si no se trata adecuadamente. Por otra parte, los nodavirus afectan seriamente a la producción de lubina.

Otro aspecto común que afecta a las tres especies es la necesidad de incrementar la tasa de crecimiento, tanto a nivel de desarrollo muscular, como mediante la modificación de las proporciones sexuales una vez conocidos los mecanismos de diferenciación gonadal. En este sentido, el estudio del desarrollo larvario, la diferenciación gonadal y la nutrición y alimentación son aspectos prioritarios. Uno de los principales problema del cultivo de la dorada es la presencia de anomalías morfológicas (lordosis, falta de opérculo, anomalías mandibulares, de la línea lateral que en algunos casos pueden afectar a más del 50% de los individuos de un lote particular.

Por último, la reproducción es uno de los aspectos con una mayor repercusión en la producción, fundamentalmente de lubina y rodaballo: La lubina se ha consolidado como modelo de investigación sobre la fisiología de la reproducción de peces marinos de interés comercial, cuyos conocimientos pueden servir para ayudar en la solución de problemas en otras especies. El control de la diferenciación sexual y la pubertad son fundamentales para aumentar la competitividad de las empresas dedicadas a su cultivo. Finalmente, cabe mencionar que a pesar de que el cultivo de esta especie está muy desarrollado, a los problemas mencionados anteriormente hay que sumar la escasez de estudios genéticos y la falta de caracterización de cepas (relaciones del tipo variante-carácter productivo).

El rodaballo normalmente no presenta problemas asociados a la maduración precoz al tener lugar habitualmente más tarde en relación al ciclo de producción. Sin embargo, el rodaballo es la especie cultivada en España en la que el crecimiento diferencial entre sexos es más acusado. Así pues, las hembras alcanzan el tamaño comercial entre dos y tres meses antes que los machos. Por consiguiente, la producción de lotes formados mayoritariamente por hembras es muy deseable para el sector privado, porque se disminuiría la dispersión de tallas y se maximizaría la capacidad de producción de las instalaciones disminuyendo en proporción los costes de producción de otros componentes.

Participantes: 

- CSIC
o Instituto Investigaciones Marinas Vigo,
o Instituto de Acuicultura de Torre la Sal, Castellón,
o Instituto de Ciencias de Mar de Andalucía, Cádiz,
o Instituto de Ciencias Marinas, Barcelona
- Instituto Nacional de Investigaciones Agrarias
- Instituto Nacional de Bioinformática
- Universidad de Barcelona
- Universidad Autónoma de Barcelona
- Universidad de Santiago de Compostela
- Universidad Miguel Hernández
- Universidad de Murcia
- Universidad Complutense

•    DATOS DEL COORDINADOR

Antonio Figueras es el coordinador del proyecto. El Coordinador es el responsabe de todos los contactos entre el proyecto y la Comisión Gestora Consolider. El Dr Antonio Figueras posee más de 15 años de experiencia en la dirección técnica y administrativa de proyectos de investigación a nivel nacional e internacional.

Nacido en 1957. Casado con dos hijos. Doctor en Biología. Profesor de Investigación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Es autor de más de 170 trabajos científicos publicados en revistas del Scientific Citation Index, además de otros artículos, libros y capítulos de libros. Su formación de postgrado se desarrolló en Estados Unidos (Rutgers University y Harvard University) y en el Reino Unido (Aberdeen University) . Ha sido investigador responsable de proyectos nacionales (CICYT, Xunta de Galicia), y europeos y director de 16 Tesis Doctorales. Antonio Figueras es el responsable del Laboratorio Nacional de Referencia para enfermedades de moluscos bivalvos y ha recibido, entre otros, el premio de Investigación de la Real Academia Gallega de Ciencias-Fundación Caixa Galicia y el Premio de Investigación en Acuicultura de la Junta Asesora de Cultivos Marinos (JACUMAR). Es experto privado de la Unión Europea y Miembro del Grupo de Trabajo del Comité Veterinario Permanente que asesora a la Comisión Europea en temas de Patología de Organismos procedentes de la Acuicultura. También fue miembro del Comité Científico Interdisciplinar sobre la Investigación en Encefalopatías Espongiformes Transmisibles (EETs) del MCyT. Miembro del Comité Científico Asesor para el hundimiento del Prestige. Delegado español de la Sociedad Europea de Patología de Peces y Moluscos. (EAFP). Director del Instituto de Investigaciones Marinas (CSIC) desde el año 2001 al 2006. Coordina la Red de Investigación en Acuicultura del CSIC (RIAC). En la actualidad es coordinador del Proyecto Aquagenomics (Consolider-Ingenio 2010) para el desarrollo de herramientas biotecnológicas en la mejora de la producción de la Acuicultura. Mantiene el blog Ciencia Marina y otros Asuntos en la web madrid i+d (http://weblogs.madrimasd.org/ciencia_marina/default.aspx). Colabora habitualmente con distintos medios de comunicación (El País, El Mundo, Público, Faro de Vigo)

LINEAS DE INVESTIGACION ACTUALES
- Estudio de enfermedades de peces y moluscos bivalvos.
- Estudio de la respuesta inmune (funcional y molecular) de moluscos y peces frente a agentes patógenos y potenciación de esta respuesta.


El coordinador será responsable de:
-    Manejo general de las actividades de investigación asistidos por los responsables de área
-    En colaboración con el responsable administrativo, asegurar una correcta relación entre las partes administrativas y científicas del proyecto
-    Coordinar la generación de conocimiento y otras actividades relacionadas de innovación
-    Con la ayuda del grupo de bioinformática (INB), crear y mantener la página Web del proyecto.
-    Llevar cabo un seguimiento activo y continuo del progreso científico de acuerdo con el plan de trabajo, con el fin de conseguir los resultados e hitos previstos.
-    El coordinador será asistido por el Comité de Coordinación incluye al coordinador científico y los 8 responsables de área. Las áreas de trabajo (Inmunología y enfermedad, Crecimiento, Nutrición y Desarrollo, Reproducción, Genética, Microarrays, Bioinformática, Formación) agrupan a los participantes que realizan investigación en temas similares.

Duracion: 
2008-2012
Presupuesto: 
6.000.000 €
Comunicaciones: 

• PÁGINA WEB

La página del proyecto Aquagenomics Consolider es:

http://aquagenomics.es

Sobre los Consolider Ingenio 2010.

http://web.micinn.es/contenido.asp?menu1=1&menu2=2&dir=03_Plan_IDI/00-LI...


• ARTÍCULOS PUBLICADOS, PROYECTOS RELACIONADOS Y BIBLIOGRAFIA

2008

1) Scientific papers.

S. Ruiz, C. Tafalla, A. Cuesta, A. Estepa, J.M. Coll. 2008. In vitro search for alternative promoters to the human immediate early cytomegalovirus (IE-CMV) to express the G gene of viral haemorrhagic septicemia virus (VHSV) in fish epithelial cells. Vaccine 26: 6620-6629

Estepa, A, Tafalla, C and Coll, JM. 2008. Defence mechanims againts viral infections in fish: the trout/ viral haemorrhagic septicaemia (VHSV) rhabdovirus model. In Fish Defences: Fish Armament and Secretions (ISBN-13: 9781578084074) Volumen: 2. Editors. G. Zaccone, M. J. Manning, C. J. Secombes and B.G. Kapoor. Science publishers. USA.

Marroqui, L., Estepa, A. And Perez, L. 2008. Inhibitory effect of mycophenolic acid on the replication of infectious pancreatic necrosis virus and viral hemorrhagic septicemia virus. Antiviral Research. 80: 332-338

Osorio, CR., Marrero, J., Wozniak, R:A.F., Lemos, M.L., Burrus, V & Waldor,M.K. Genomic and functional analysis of ICEPdaSpa1, a fish-pahogen-derived SXT-reated integrating conjugative element that can mobilize a virulence plasmid. Journal of Bacteriology 190: 3353-361 (2008)

Cutrín, J.M., Olveira, J.G., Bandín, I. & Dopazo, C.P. (2008) Validation of real time RT-PCR for diagnosis of any genotype of viral haemorrhagic septicaemia virus. Journal of Virological Methods (In press)

Leiro, J., Piazzón, M.C., Budiño, B., Sanmartín, M.L., Lamas, J. (2008) Complement-mediated killing of Philasterides dicentrarchi (Ciliophora) by turbot serum: relative importance of alternative an d classical pathways. Parasite Immunology 30: 535-543.

Piazzón, C., Lamas, J., Castro, R., Budiño, B., Cabaleiro, S., Sanmartín, M.L., Leiro, J. (2008). Antigenic and cross-protection studies on two turbot scuticociliate isolates. Fish & Shellfish Immunology 25: 417-424.

Castro, R., Lamas, J., Morais, P., Sanmartín, M.L., Orallo, F., Leiro, J. (2008). Resveratrol modulates innate immune responses in turbot leucocytes. Veterinary Immunology and Immunopathology 126: 9-19.

Francesc Piferrer, Yann Guiguen. Fish Gonadogenesis. Part II: Molecular Biology and Genomics of Sex Differentiation. Reviews in Fisheries Science, Volume 16, Issue S1 2008 , pages 35 - 55

Bouza C., Hermida M., Millán A., Vilas R., Vera M., Fernández C., Calaza M., Pardo B.G. & Martínez. P. 2008. Characterization of EST-derived microsatellites for gene mapping and evolutionary genomics in turbot. Animal Genetics, 39:666-670.

2) PhD Thesis

Mª Pilar Sepulcre Cortés. Implication of receptors similar to Toll (TLRs) on the innate immune response of teleostei. University of: Murcia. 11/07/08

3) Scientific meetings

Novoa et al., Studies on host defence mechanisms against pathogens and pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) in zebrafish. 8th International zebrafish development and genetics conference.University of Wisconsin-Madison, 24-29 Junio 2008.

Rotllant et al. The role of osteonectin (SPARC) in zebrafish embryonic hematopoiesis. 8th International zebrafish development and genetics conference. University of Wisconsin-Madison, 24-29 Junio 2008.

Rotllant et al., The matricellular glycoprotein Osteonectin is required for skeletal development and hematopoietic maturation. Join meeting of the British and Spanish developmental biology societies . Sevilla (SPAIN), 24-27 Septiembre 2008.

Piferrer, F., M. Blázquez, J. Viñas, L. Navarro, N. Ospina-Álvarez, 2008. Temperature-Dependent Sex Determination in Fish: Molecular Mechanisms, Epigenetics, Reaction Norms and Prevalence. International Symposium on Sex Determination and Gametogenesis in Fish: Current Status and Future Directions. Honolulu, EE.UU. 29-31 de Mayo de 2008.

Piferrer, F., M. Blázquez, J. Viñas, L. Navarro, N. Ospina-Álvarez, 2008. Temperature-Dependent Sex Determination in Fish. Effects of Temperature on Gonadal Aromatase Gene Expression and Epigenetic Regulation After Early Exposure to High Water Temperature. 6th International Symposium on Fish Endocrinology. Calgary, Canada, 22-27 de Junio de 2008.

Piferrer, F., Y. Guiguen, A. Fostier, 2008. Monosexing to improve production and quality. Workshop on the Future Prospects for Aquaculture Breeding in Europe. Paris, 1-3 Octubre 2008.

Mechaly, A., J. Viñas, F. Piferrer, 2008. Presence of two alternative splice isoforms of the
kisspeptin-1 receptor (kiss1r) in a modern teleost, the Senegalese sole (Solea senegalensis). 1st World Conference on Kisspeptin Signaling in the Brain. Córdoba. 8-11 de Octubre de 2008.

Improving reproduction using light and temperature control: Mediterranean species (M. Carrillo, CSIC; Sterilizing fish to protect biodiversity and improve quality (A. Felip, CSIC). Reprofish / Aquabreeding and European fish hatchery industry meeting. Paris, France - October 2008.

S. Zanuy, M. Carrillo, A. Felip, B. Crespo, A. Gómez and M.J. Mazón. Advances in the control of puberty and reproductive cycle in European sea bass, Dicentrarchus labrax. Aquaculture Europe 2008, Krakow, September 2009.

M. Carrillo, S. Zanuy, A. Felip, M.J. Bayarri, G. Molés, M.J. Mazón, A. Gomez. Hormonal and environmental control of puberty in perciform fish: the case of sea bass. 24rd Conference of European Comparative Endocrinologists. Genova, Septiembre , 2008.

Bermejo Nogales A, Saera-Vila A, Benedito-Palos L, Calduch-Giner J, Pérez-Sánchez J. Differential tissue expression of uncoupling proteins in gilthead sea bream (Sparus aurata): Lessons from UCP1 and UCP3 in fish 25th Congress of the European Society of Comparative Biochemistry and Physiology. September 2008. Ravenna, Italia

Calduch-Giner J, Saera-Vila A, Cairns M, Davey G, Pérez-Sánchez J. Time series analyses of sea bream stress response alter confinement exposure. 25th Congress of the European Society of Comparative Biochemistry and Physiology. September 2008. Ravenna, Italia

Leal E, Sánchez E, Muriach B, Cerdá-Reverter JM. Sex-steriod induced inhibition of food intake in sea bass (Dicentrarchus labrax). Fifth International Symposium on Fish Endocrinology (V-ISFE). Calgary, Canada. June, 2008.

Capilla, E., Diaz, M., Hou, J-C., Planas, J.V., Pessin, J. E. Differences in traffic between mammalian and fish GLUT4 may unveil differences in intracellular retention mechanisms. 90th Annual Meeting of the Endocrine Society. San Francisco, USA. June, 2008

V. Chico, M. Ortega-Villaizan Romo, A. Falcó, I. Brocal, L. Pérez, JM Coll y A. Estepa. Pepscan mapping of the major type I IFN-inducing regions in viral haemorrhagic septicaemia rhabdovirus (VHSV)- G glycoprotein. Congreso: XIV International congress of virology. Estambul (Turquia) 10-15 Agosto 2008.

Perez, L.,Marroqui, L,Chico Gras, V.,Ortega-Villaizan Romo, M and Estepa, A. In vitro efficacy of ribavirin and mycophenolic acid against rainbow trout viruses IPNV and VHSV. The 7th symposium on diseases in asian aquaculture. Taipei (Taiwan) 22-29 Junio 2008

V. Chico, M. Ortega-Villaizan Romo, A., L. Pérez, R. Mallavia, JM Coll y A. Estepa. Induction of type I interferon by VHSV: role of surface glycoprotein G. 5TH International conference on innate immunity. Creta (Grecia) 19-22 Junio 2008.

Cancio I, Bilbao E, Diaz de Cerio O, Pardo BG, Millán A, Fernández, C, Martínez P, Cajaraville MP. Gene expression analysis after exposure to nº2 fuel oil exposure in the liver of juvenile turbots (Scophthalmus maximus) using a custom oligonucleotide microarray. Mayo 2008, Varsovia, Polonia.

Martínez P, Pardo BG, Fernández C, Millán A, BouzaC, HermidaM, VeraM, Vilas R, Alvarez-Dios JA, Calaza M, Gómez-Tato A, Vázquez M, Cabaleiro S, Magariños B, Lemos ML Leiro JM. Genómica Aplicada para la mejora del cultivo de rodaballo (II): Identificación de genes de resistencia a patógenos emergentes mediante análisis microarray. XVII Seminario de Genética de Poblaciones y Evolución. Noviembre 2008. Ribadesella.


4) Dissemination.

Dr. A. Figueras has published several dissemination articles and was interviewed on Aquagenomics in different newspapers (see Annexes):

- Galicia liderará un proyecto de Acuicultura... La Voz de Galicia. 16.02.2008. report on Aquagenomics.

- A la busqueda del superrodaballo. La Voz de Galicia. 20.04.2008. Report and interview.

- Biotecnología que mejore la Acuicultura. El País. 16.11.08. Article by A. Figueras.

Aquagenomics is mentioned in a RTVE documentary on the ICMAN. Series "La Aventura del Saber", broadcasted on October 1st, 2008.

Dr. Antonio Figueras participated in "IX Feria Madrid es Ciencia" with the conference: "Mar, contaminación y biotecnología", Madrid (España). 24 Abril 2008

Blog by Dr. A Figueras (http://weblogs.madrimasd.org/ciencia_marina/)


Other activities

The participants of the Immunology group have participated in the Course of Immunology organized by the "Red of Biotecnología en Acuicultura de Galicia" at Santiago de Compostela.

Course "A Bioinformática como ponte entre a xenética e as súas aplicacións industriais e biomédicas" de la Universidad de Santiago de Compostela. 30 h. Director: Dr. José Antonio Álvarez-Dios. Talks by Dr. Paulino Martínez, Dra. Carmen Bouza and Antonio Gómez-Tato. Julio 2008, Santiago de Compostela.

2009

1) Papers in SCI journals (with acknowledgements to Aquagenomics project)

1. Ruiz S, Schyth BD, Encinas P, Tafalla C, Estepa A, Lorenzen N, Coll JM. 2009. New tools to study RNA interference to fish viruses: Fish cell lines permanently expressing siRNAs targeting the viral polymerase of viral hemorrhagic septicemia virus. Antiviral Res. 82(3):148-56.
2. Falco A, Encinas P, Carbajosa S, Cuesta A, Chaves-Pozo E, Tafalla C, Estepa A, Coll JM. 2009. Transfection improvements of fish cell lines by using deacylated polyethylenimine of selected molecular weights. Fish Shellfish Immunol. 26(3):559-66.
3. Cuesta A, Tafalla C. 2009. Transcription of immune genes upon challenge with viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) in DNA vaccinated rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Vaccine. 7;27(2):280-9.
4. Chico V, Ortega-Villaizan M, Falco A, Tafalla C, Perez L, Coll JM, Estepa A. 2009. The immunogenicity of viral haemorragic septicaemia rhabdovirus (VHSV) DNA vaccines can depend on plasmid regulatory sequences. Vaccine. 18;27(13):1938-48.
5. Ortega-Villaizan M, Chico V, Falco A, Perez L, Coll JM, Estepa A. 2009. The rainbow trout TLR9 gene and its role in the immune responses elicited by a plasmid encoding the glycoprotein G of the viral haemorrhagic septicaemia rhabdovirus (VHSV). Mol Immunol. 46(8-9):1710-72009.
6. Falco A, Ortega-Villaizan M, Chico V, Brocal I, Perez L, Coll JM, Estepa A. 2009. Antimicrobial peptides as model molecules for the development of novel antiviral agents in aquaculture. Mini Rev Med Chem. 9(10):1159-64.
7. Cutrín JM, Olveira JG, Bandín I, Dopazo CP. 2009. Validation of real time RT-PCR applied to cell culture for diagnosis of any known genotype of viral haemorrhagic septicaemia virus. J Virol Methods. 162(1-2):155-62.
8. Olveira JG, Souto S, Dopazo CP, Thiéry R, Barja JL, Bandín I. 2009. Comparative analysis of both genomic segments of betanodaviruses isolated from epizootic outbreaks in farmed fish species provides evidence for genetic reassortment. J Gen Virol.; 90:2940-51.2009.
9. Lamas J, Morais P, Arranz JA, Sanmartín ML, Orallo F, Leiro J. 2009. Resveratrol promotes an inhibitory effect on the turbot scuticociliate parasite Philasterides dicentrarchi by mechanisms related to cellular detoxification. Vet Parasitol. 12;161(3-4):307-15.
10. Morais P, Lamas J, Sanmartín ML, Orallo F, Leiro J. 2009. Resveratrol induces mitochondrial alterations, autophagy and a cryptobiosis-like state in scuticociliates. Protist. 160(4):552-64.
11. MacKenzie S, Ribas L, Pilarczyk M, Capdevila DM, Kadri S, et al. 2009. Screening for Coping Style Increases the Power of Gene Expression Studies. PLoS ONE 4(4): e5314.
12.Castillo-Briceño P, Sepulcre MP, Chaves-Pozo E, Meseguer J, García-Ayala A, Mulero V. 2009. Collagen regulates the activation of professional phagocytes of the teleost fish gilthead seabream. Mol Immunol.;46(7):1409-15.
13. Sepulcre MP, Alcaraz-Pérez F, López-Muñoz A, Roca FJ, Meseguer J, Cayuela ML, Mulero V. 2009. Evolution of lipopolysaccharide (LPS) recognition and signaling: fish TLR4 does not recognize LPS and negatively regulates NF-kappaB activation. J Immunol. 15;182(4):1836-45.
14. López-Muñoz A, Roca FJ, Meseguer J, Mulero V. 2009. New insights into the evolution of IFNs: zebrafish group II IFNs induce a rapid and transient expression of IFN-dependent genes and display powerful antiviral activities. J Immunol. 15;182(6):3440-9.
15. Novoa B, Bowman TV, Zon L, Figueras A. 2009. LPS response and tolerance in the zebrafish (Danio rerio). Fish Shellfish Immunol;26(2):326-31.
16. Rodríguez I, Chamorro R, Novoa B, Figueras A. 2009. beta-Glucan administration enhances disease resistance and some innate immune responses in zebrafish (Danio rerio). Fish Shellfish Immunol.;27(2):369-73.
17. Poisa-Beiro L, Dios S, Ahmed H, Vasta GR, Martínez-López A, Estepa A, Alonso-Gutiérrez J, Figueras A, Novoa B. 2009. Nodavirus infection of sea bass (Dicentrarchus labrax) induces up-regulation of galectin-1 expression with potential anti-inflammatory activity. J Immunol. 15;183(10):6600-11.
18. Leal E, Sánchez E, Muriach B, Cerdá-Reverter JM. Sex Steroid-Induced Food Intake Inhibition in the Sea Bass (Dicentrarchus labrax). Journal of Comparative Physiology B, 179:77 - 86, 2009.
19. Sánchez E, Rubio VC, Thompson D, Metz J, Flik G, Millhauser GL, Cerdá-Reverter JM. Phosphodiesterase inhibitor-dependent inverse agonism of agouti-related protein (AGRP) on melanocortin 4 receptor in sea bass (Dicentrarchus labrax). American Journal of Physiology, Regulatory, Integrative and Comparative Physiology, 296:R1293-R1306, 2009.
20. Saera-Vila A, Calduch-Giner JA, Prunet P, Pérez-Sánchez J. Dynamics of liver GH/IGF axis and selected stress markers in juvenile gilthead sea bream (Sparus aurata) exposed to acute confinement: differential stress response of growth hormone receptors. Comp Biochem Physiol A Mol Integr Physiol. 2009;154:197-203;
21. Saera-Vila A, Benedito-Palos L, Sitja-Bobadilla A, Nacher-Mestre J, Serrano R, Kaushik S, Pérez-Sánchez J. Assessment of the health and antioxidant trade-off in gilthead sea bream (Sparus aurata) fed alternative diets with low levels of contaminants. Aquaculture. 2009;296:87-95
22. Cruz-Garcia L, Saera-Vila A, Navarro I, Calduch-Giner J, Pérez-Sánchez J. Targets for TNFalpha-induced lipolysis in gilthead sea bream (Sparus aurata L.) adipocytes isolated from lean and fat juvenile fish. J Exp Biol. 2009 212:2254-60.
23. Castillo J, Crespo D, Capilla E, Díaz M, Chauvigné F, Cerdà J, Planas JV. Evolutionary structural and functional conservation of an ortholog of the GLUT2 glucose transporter gene (SLC2A2) in zebrafish. Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2009, 297:R1570-81
24. Sánchez-Ferez, J.A., Sánchez-Vázquez, F.J. Feeding entrainment of daily rhythms of locomotor activity and clock gene expression in zebrafish brain. Chronobiology International. 2009, 26: 1120-1135.
25. Monroig O, Rotllant J, Sánchez E, Cerdá-Reverter JM, Tocher DR. 2009. Expression of long-chain polyunsaturated fatty acid (LC-PUFA) biosynthesis genes during zebrafish Danio rerio early embryogenesis.Biochim Biophys Acta Nov;1791(11):1093-101
26. Martínez, P., Bouza, C., Hermida, M., Fernández, J., Toro, M. A., Vera, M., Pardo, B., Millán, A., Fernández, C., Vilas, R., Viñas, A., Sánchez, L., Felip, A., Piferrer, F., Ferreiro, I. y Cabaleiro. 2009. Identification of the major sex-determining region of turbot (Scophthalmus maximus). Genetics 183: 1443-1452).
27. Piferrer, F., A. Beaumont, J.C. Falguière, M. Flajshans P. Haffray, L. Colombo, 2009. The use of induced polyploidy in the aquaculture of bivalves and fish for performance improvement and genetic containment. Aquaculture, 293: 125-156.

Moreover, three book chapters have been published during 2009:
-Estepa et al. Defence mechanims againts viral infections in fish: the trout/ viral haemorrhagic septicaemia (VHSV) rhabdovirus model. In: Fish Defences Volume 2: Pathogens, Parasites and Predators, 2: 63-109. Science publishers, USA (ISBN: 978-1-57808-407-4).

- Zanuy, et al. 2009. Regulación y control hormonal del proceso reproductor de los teleósteos. En: La reproducción de los peces: aspectos básicos y sus aplicaciones en acuicultura. M. Carrillo (coord.). Pp: 97-172. Pub. Cient. Tec. OESA (CSIC, Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino), Madrid, España.

- Piferrer, F. 2009. Determinación y diferenciación sexual de los peces. En: M. Carrillo (coord.). Reproducción en acuicultura, pp. 249-336. Observatorio Español de Acuicultura, Consejo Superior de Investigaciones Científicas y Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación, Madrid. ISBN: 978-84-00-08842-2.


2) PhD Thesis 2009
1. Francisco José Roca Soler. Caracterization of the biological activity of the tumoral necrosis factor alfa of teleostei. Universidad de Murcia. 23/01/09

2. Laura Poisa Beiro. Genes involved on the response of sea bass (Dicentrarchus labrax) against nodavirus. Universidad de Santiago de Compostela. 13/02/09

3. Iván Rodríguez. Infección de Aeromonas hydrophila en pez cebra. Inmunomodulación del sistema inmune. Universidad de Vigo. 19 /6/ 2009.

4. Barbara Castellana. Studies on the innate immune system of the seabream (Sparus aurata): genomic approaches for the identification of immune-relevant genes and their molecular characterization. Universitat de Barcelona.

5. José Fernando López. Circadian modulation of the biological clock and behavioral, endocrine and metabolic rhythms of teleostean fishes. Universidad de Murcia


3) Presentations in International Scientific Meetings

21 presentations were done by the Aquagenomics participants during 2009 in international meetings.


4) Dissemination


Dr. A. Figueras has published several dissemination articles and was interviewed on Aquagenomics in different newspapers, which are icluded in the public domain of the Project web page.

Dr. A Figueras Blog (http://weblogs.madrimasd.org/ciencia_marina/)

Dr Figueras has participated in the programme "Itinerarios Científicos, CSIC Galicia" for dissemination of the research activitis at the Instituto de Investigaciones Marinas, CSIC, Vigo 27 .12. 2009.

Dr Figueras has participated in the project "Neuston. Experimento 1. Explorando a Interface" which looks for the cooperation between scientists and artists. The results of the Project were included in an exposition and in a book (ISBN: 978-84-936963-3-7).

Dr MacKenzie gave a conference at the Universidad Santiago de Chile, Chile titled;
‘Biotechnology in Aquaculture and the potential of genomics' 10.11.2009.

José Manuel Leiro gave a conference at the I Jornadas Técnicas AROGA -Cluster Acuicultura de Galicia-Apromar. Acuicultura marina y continental. "PARÁSITOS EN ACUICULTURA: AMENAZA VIEJA, PROBLEMA EMERGENTE Vigo, 18. 9. 2009.


5) Patents and transference to the industry

- Patent: Early identification of sex in turbot. Universidad de Santiago de Compostela.

- Industrial Project for the genetic selection of turbot with INSUIÑA SA. Universidad de Santiago de Compostela and ICM CSIC.

- Establishment of a contractual agreement with Skretting, leading company on the world stage for fish diet production. Agreement exploits screening technologies developed in primary cultures of finfish macrophages. The objective is to screen for novel immunostimulatory compounds for diet development. Universidad Autónoma de Barcelona.


6) Other important achievements

- The group of Dra Amparo Estepa from the Universidad Miguel Hernández has received the VIII Nacional Award of Investigation in Aquaculture for the work "Diseño de nuevas vacunas ADN frente a virus en peces: inmunogenicidad y protección conferida por la proteína G del rhabdovirus de la SHV expresada bajo el control de secuencias reguladoras del gen de la beta-actina de carpa". 30 de Noviembre de 2009. (Orden ARM/499/2009 de 24 de febrero, BOE nº 53)